Οι Φορείς Διαχείρισης ωστόσο παραμένουν «περιορισμένης ευθύνης» όργανα και με γνωμοδοτικό χαρακτήρα, παρά τις εξαγγελίες του 2014 για αναβαθμισμένα όργανα που θα παίζουν αποφασιστικό ρόλο στη διαμόρφωση της περιβαλλοντικής πολιτικής του ελληνικού κράτους.
Υπάρχει ακόμη και το ζήτημα των εργαζομένων, του καθεστώτος λειτουργίας των Φορέων και του τρόπου πληρωμής όσων εργάζονται σε αυτούς, καθώς στο παρελθόν υπήρξαν σημαντικά προβλήματα. Στο σχετικό ρεπορτάζ της εφημερίδας υπογραμμίζεται πως: «Όπως προκύπτει, όσοι απασχολούνται σήμερα στους φορείς διαχείρισης (και οι οποίοι, σημειωτέον, έχουν αποκτήσει πολύτιμη εμπειρία με το πέρασμα σχεδόν μιας δεκαπενταετίας) θα διατηρηθούν με το ίδιο προσωρινό σχήμα και το 2018 (με οκτάμηνες αντί για ετήσιες συμβάσεις), με τη μισθοδοσία να καλύπτεται από το Πράσινο Ταμείο (τα λειτουργικά έξοδα και τα επιστημονικά κόστη θα μεταφερθούν στον προϋπολογισμό). Κατόπιν θα πραγματοποιηθεί διαγωνισμός μέσω ΑΣΕΠ (στον οποίο οι έχοντες ήδη εμπειρία στους φορείς θα μοριοδοτούνται). Τα διοικητικά συμβούλια των φορέων θα παραμείνουν άμισθα, όπως σήμερα».